Usando o certificado digital da Matriz ou do Contador

Importante I: essa possibilidade é dependente de permissão do município. 

Importante II: Para o caso em que o eCNPJ que for ser utilizado para transmissao e assinatura do RPS seja o certificado da Matriz da empresa, ou o eCNPJ do contador do cliente, é necessário nos enviar o número do CNPJ relacionado a esse certificado pois precisamos cadastrá-lo no sistema (caso permitido pelo município). Isso é necessário mesmo no ambiente de homologação.

Nesse caso, é preciso informar o CNPJ do contribuinte juntamente com o CNPJ de terceiro.

Veja aqui como contactar o suporte: 

http://suporte.integragrp.com.br/hc/pt-br/articles/207165586-Como-obter-suporte-a-respeito-da-integra%C3%A7%C3%A3o-ABRASF