Qualquer nota fiscal eletrônica que não tenha tido o seu ISS pago pode ser cancelada. Porém, a opção de cancelar estará desativada caso existam guias emitidas para a nota. Para prosseguir, é necessário cancelar qualquer guia associada com a nota. Depois de todas as guias associadas forem canceladas, a opção de cancelar a nota estará disponível.
Porém, é muito importante não cancelar guias que já foram pagas. Veja o tópico O que preciso saber antes de cancelar uma guia?
Uma NF-e que estiver disponível para ser cancelada terá um link chamado "Cancelar" mostrado ao passar o mouse em cima da mesma.
Para achar uma nota, faça uma busca com o número completo ou parcial da nota, ou com alguma outra informação (ex: nome do tomador, etc).